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Universität Freiburg - Institut für Informatik
Lehrstuhl für Mustererkennung und Bildverarbeitung (LMB)
[-]LMB
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    |  | Professor:
    |  |-Prof. Dr.-Ing. Hans Burkhardt
    |  | Secretary:
    |  |-Cynthia Findlay
    |  | Research Ass.:
    |  |-Nikos Canterakis
    |  |-Robert Bensch
    | [+]Janis Fehr
    |  |-Margret Keuper
    |  |-Lingyu Ma
    |  |-Marco Reisert
    |  |-Olaf Ronneberger
    |  |-Thorsten Schmidt
    |  |-Janina Schulz
    |  |-Henrik Skibbe
    |  |-Maja Temerinac
    |  |-Alexandra Teynor
    |  |-Qing Wang
    |  |-Wan Nural Jawahir
    |  | Tech. Staff:
    |  |-Stefan Teister
    |  | Students:
    |  |-Matthias Demant
    |  |-Dominik Ruess
    |  |-Matthias Schlachter
    |  |-Matthias Schmieder
    |  |-Alexander Streicher
    |  |-Benjamin Traut
    |  | Visiting Scientists:
    |  | Former members:
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    |  |-Gerd Brunner
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    |  |-Mario Emmenlauer
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    |  |-Sebastien Lefevre
    |  |-Prof. Dr. Zhe-Ming Lu
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Thorsten Schmidt Dipl.-Inf. Thorsten Schmidt
Chair of Pattern Recognition and Image Processing
Institute for Computer Science
Albert-Ludwigs-University
Georges-Koehler-Allee 052, room 01-021
D-79110 Freiburg i.Br., Germany
Phone: +49-(0)761-203-8266
Fax: +49-(0)761-203-8262
Email: tschmidt AT informatik.uni-freiburg.de

Scientific Interests

  • Digital pre-processing of microscopic data
  • Quantitative image analysis in Systems biology
  • Feature based analysis of dynamic biological processes

Projects

  • Statistic modelling of the Root Apical Meristem in Arabidopsis thaliana

Publications

Conference Papers

  • Fast Scalar and Vectorial Grayscale Based Invariant Features for 3D Cell Nuclei Localization and Classification
    Janina Schulz, Thorsten Schmidt, Olaf Ronneberger, Hans Burkhardt, Taras Pasternak, Alexander Dovzhenko and Klaus Palme
    In DAGM '06 Annual Pattern Recognition Symposium, September 2006, Berlin, Germany (DAGM Prize) [pdf]

Diploma Thesis

  • Automatic selection of optimal Kernel functions for grayscale invariants [pdf]
    (Original title: Automatische Selektion von optimalen Kernfunktionen für Grauwertbasierte Invarianten)

Student Research Project

  • Development of preprocessing techniques (Deconvolution, etc.) for fluorescence microscopic 3-D volume data for enhancement of subsequent recognition using grayscale invariants [pdf]
    (Original title: Entwicklung von Vorverarbeitungsverfahren(Enfaltung, etc.) für fluoreszenzmikroskopische 3D Volumendaten zur Verbesserung der Nachfolgenden Erkennung Mittels Grauwertbasierter Invarianten)

Teaching

Lectures

Seminars

Lab-Sessions

Supervised theses:

  • Student research Project: Quantitative Analyse mikroskopischer Aufnahmen von Moos-Protoplasten
    Matthias Schlachter, November 2006 - May 2007
Last modified on Thursday 2007/07/05 by Thorsten Schmidt