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Dipl. Inf. Mario Emmenlauer | |
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Adresse LMB, Freiburg (alt): Lehrstuhl für Mustererkennung und Bildverarbeitung Albert-Ludwigs-Universität Georges-Köhler-Allee 052, Raum 01-017 D-79110 Freiburg i.Br. |
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Adresse Bitplane AG, Zürich (aktuell): Bitplane AG Badenerstrasse 682 8048 Zürich, Schweiz |
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| Telefon: | +49-(0)176-23463809 | |
| Email: |  |
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| Biologische und medizinische Signalverarbeitung, 3D und 4D (3D + Zeit), Registrierung von großen Bild-Datensätzen, Fusionierung, Spine- und Neuronentracking. Plattformunabhänige Programmierung in C/C++, Templates, Compiler, 64bit, CPU/GPU Programmierung. |
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M. Emmenlauer, O. Ronneberger, A. Ponti, P. Schwarb, A. Griffa, A. Filippi, R. Nitschke, W. Driever, and H. Burkhardt.
"Xuvtools: Free, fast and reliable stitching of large 3d datasets"
Journal of Microscopy (2009) Vol 233 Issue 1 pp. 42--60 (doi:10.1111/j.1365-2818.2008.03094.x)
Paper (on publisher site, free access)
[pdf]
M. Emmenlauer, O. Ronneberger, H. Burkhardt, A. Ponti, P. Schwarb, R. Nitschke, and W. Driever.
"XuvTools: Fast and reliable stitching of large 3D datasets"
European Light Microscopy Initiative ELMI (2008)
Poster
[pdf]
M. Emmenlauer and O. Ronneberger and M. Temerinac and H. Burkhardt and A. Filippi and R. Nitschke and W. Driever
"Fast Automatic Recombination of Multiple 3D Datasets for Large Volumes and High Dynamic Range (HDR)"
49th Symposium of the Society for Histochemistry (2007)
Poster
[pdf]
Mario Emmenlauer
"Feature- und Deformationsmodell-basierte Registrierung von 3D Volumendaten von Zebrafischen"
Diplomarbeit
[pdf]
[ps.gz],
Vortrag
[pdf]
XuvTools: Free, Fast and Reliable Stitching of Large 3D Datasets
XuvTools ist eine vollautomatische Software zum Stitchen sehr großer
3D Bildstapel von konfokalen Mikroskopen. Für ein optimales Ergebnis wird
vorrausgesetzt dass die Bildstapel ohne Verzeichnungen und Verzerrungen aufgenommen
worden sind, und einen ausreichenden Überlappungsbereich zwischen benachbarten
Bildstapeln aufweisen.
Sind diese Vorraussetzungen bei der Aquisition erfüllt, so setzt die Software
die Bildstapel vollautomatisch zu einem Mosaikbild zusammen.
XuvTools wurde mit besonderem Augenmerk auf Geschwindigkeit und Präzision
entwickelt, und arbeitet vollkommen automatisch, ohne daß vorher Tiles
manuell angeordnet werden müssten.