abstract

A problem of registering many data sets - whose correspondences can be determined by cross correlation, by automatically finding landmarks or by other methods - is the possible ambiguitiy of the pairwise correspondences. Quite often, the decision of which correspondences are correct and which are outliers can only be determined in the actual process of registering the datasets.
A standard approach is to use the RANSAC algorithm. However, this algorithm doesn't converge very well. The goal of this research project is to find and analyse extensions of the RANSAC algorithm or alternative methods (e.g. graph based approaches) which are suitable for the stitching problem and the landmark based registration.

Markov Random Field based registration approaches for a 4D Zebrafish atlas

German: Nachdem für viele Organismen das komplette Genom sequenziert ist, beschäftigt sich die aktuelle Forschung mit der Frage, welche Gene zu welchem Zeitpunkt an welcher Position abgelesen werden. Das Fernziel ist dabei die Erstellung eines 4D Atlas (3D + Zeit) in dem für alle Gene verzeichnet ist, wann und wo sie abgelesen werden. Ziel dieser Diplomarbeit ist eine Machbarkeitsstudie zur automatischen Registrierung von 2-Photonenmikroskopischen Aufnahmen von verschiedenen Zebrafisch-Embryos um daraus einen abstrakten Atlas zu lernen. Zur Registrierung Model vs. Aufnahme, bzw. Aufnahme 1 vs. Aufnahme 2 sollen Verfahren auf der Basis von "Markow Random Fields" entwickelt werden. Darüberhinaus sollen geeignete Verfahren zur Qualitätskontrolle untersucht werden.